论文查重软件与学术出版的合作模式多种多样。一种常见的合作模式是学术出版社与论文查重软件公司建立合作关系，为投稿作者提供查重服务。通过合作，作者可以在投稿前使用查重软件检测论文相似度，确保论文原创性，提高稿件通过率。另一种合作模式是学术期刊与查重软件公司合作，期刊在投稿环节引入查重环节，加强对投稿论文的质量管控。此外，一些学术出版社还会与查重软件公司合作开展学术诚信教育活动，提升作者和读者的学术诚信意识，共同维护学术道德。

除了以上提到的合作模式，论文查重软件与学术出版还可以通过数据共享、技术对接等方式展开合作。例如，学术出版社可以与查重软件公司共享数据资源，优化查重算法，提高查重准确性和效率。同时，学术出版社还可以借助查重软件的技术优势，开发智能化的编辑系统，提升编辑效率和质量。此外，还可以探索基于区块链技术的合作模式，构建去中心化的学术出版生态，实现学术成果的安全、透明共享。综上所述，论文查重软件与学术出版的合作模式不断创新，为学术研究和学术出版带来新的发展机遇。